《审计署审计文件材料立卷归档操作规程》第六条对审计专业档案的装订顺序作出了具体规定。第七条则对档案内文件的排列规则作出了规定。以上规定都很详细，应该能够解决您的问题。
《审计署审计文件材料立卷归档操作规程》在审计署官网很容易能检索到。该文附件中有以下档案的参考样本：
1．审计档案卷内目录（参考样本）
2．审计工作底稿汇总表（参考样本）
3．审计档案卷皮书写格式（参考样本）
4．审计档案卷皮侧墙书写格式（参考样本）
5．审计档案卷内备考表（参考样本）
6．审计档案案卷目录（参考样本）
7．审计档案移交表格式（参考样本）
8．审计档案卷内目录封面（参考样本）。
1、审计准备阶段。接收委托，确定审计项目。组成审计小组了解和调查被审计单位。确定审计工作重点，制订审计工作计划方案。编制审计通知书，被审计单位承诺书。下发审计通知书。
2、审计实施阶段。对被审计单位提供的有关会计资料(包括电子文档)，实施财务审计程序。整理汇总审计实施过程中发现的问题及有关情况。审计小组汇报审计过程中发现问题和有关情况，确定需进一步核实的问题。实施相关的追加审计程序。
3、审计报告阶段。审计小组归集审计工作底稿、并编制审计报告初稿审计小组按审核后的要求，对审计报告进行修改。审计小组汇报审计报告的征求意见稿，并对审计报告的征求意见稿进行定稿。将审计报告的征求意见稿征求被审计单位意见。出具正式审计报告。
4、审计报告的终结阶段。审计小组将审计档案归档。
1、是依据目录来整理；
2、目录内容一般是类似的，都是按照审计的几个阶段分类排列相关审计底稿：一、接受业务委托，二、计划审计工作，三、实施风险评估程序，四、实施控制测试和实质性程序，五、完成审计工作和编制审计报告。而且通常最后一个阶段的底稿是排在其他阶段底稿之前的，这样可以方便快速查阅审计结论。另外，审计报告及审定财务报表要放在底稿最前面。
通常所说的按报表科目顺序来整理底稿，实际上指的是实质性程序部分的工作底稿的顺序，实质性程序的相关底稿往往会占据整个底稿的大多数，而且它对形成审计结论也有着至关重要的作用。
3、被审计单位的财务报表截止日通常为会计年度截止日，即12月31日，因为我们常见的审计大多为年度审计。因此当然也存在其他情况，要看具体审计对象。
会计年度截止日与审计截止日是不同的概念，当然审计截止日这个说法并不准确，我们一般叫做审计报告日，它与报表截止日没有什么关系，报表截止日告诉我们财务数据归属的日期或期间，而审计报告日只说明我们出具审计报告的日期。
步骤一：审计立项及授权
一、审计立项
审计立项是指确定具体的内部审计项目，即被审计的对象。审计的对象包括集团下属的各个子公司，集团内部的各职能部门、各项经营活动或者项目和系统等。
二、审计批准及授权
对于已立项的审计项目，审计部应在审计实施前以正式报告的形式报集团总裁审核、批准与授权。
步骤二：审计准备。在确定审计事项后，审计人员开始审计准备工作，制订审计计划。
步骤三：初步调查。包括审计座谈会、实地考察、研究文件资料、编写初步调查说明书。
步骤四：分析性程序及符合性测试。包括分析性程序 、描述和分析内部控制设计的恰当性、初步分析和评价内部控制执行的有效性。
步骤五：实质性测试及详细审查。包括实质性测试及详细检查是在对内部控制的初步评价基础上，运用适当的审计技术详细审查、评价被审计单位的经营活动；审计人员应收集充分的、可靠的、相关的和有用的审计证据，进行审核、分析与研究，形成审计判断。
步骤六：审计发现和审计建议。内部审计人员通过执行初步调查、符合性测试和详细审查，收集适当的、有用的及相关的审计证据，并通过分析与评价形成审计发现，并提出适当的审计建议。
步骤七：审计报告。包括审计复核与监督、整理审计工作底稿及相关资料，编写意见交换稿、与被审计单位交换意见、编制正式的审计报告、审核并报送审计报告。
步骤八：后续审计。审计人员应对相关的风险进行评价，并将后续审计的结果及相关的风险评价报告集团总裁及审计委员会。
步骤九：审计评价。审计评价是指审计部负责人对具体审计项目的执行情况、审计方法、审计程序及审计目标的完成情况进行的总结、评价。
步骤十：审计档案。完成以上九个步骤后，审计人员应对审计资料进行整理、装订、编号，形成内部审计档案，并由审计部负责保管。
